[SV] BoincSIMAP (Linux - Win - Mac)

Voir le sujet précédent Voir le sujet suivant Aller en bas

[SV] BoincSIMAP (Linux - Win - Mac)

Message par feb le Jeu 20 Sep 2007 - 13:14

A propos du projet SIMAP
SIMAP est une base de données de similitude entre protéines et des domaines protéiniques. Celle-ci rassemble toutes les séquences de protéines actuellement publiées et est continuellement mise à jour. Les similtudes entre protéines sont calculées à l'aide de l'algorithme FASTA qui fournit une vitesse optimale et une sensibilité nécessaire. Les domaines de protéines sont calculés en utilisant la base de donnée et les méthodes d'InterPro. SIMAP est selon nous le seul projet qui combine les vastes connaissances relatives à toutes les protéines actuellement connues tout en la tenant continuellement à jour.

En raison de la quantité énorme de séquences de protéine connues dans les bases de données publiques il est apparu clairement que la plupart d'entre elles n'auraient pas pu être expérimentalement testées dans un proche avenir. D'où l'utilité de la base de donnée SIMAP.

SIMAP est un projet commun du centre national de recherches GSF pour l'environnement et la santé, de l'université technique de Munich, et du centre de la vie et des sciences de l'alimentation Weihenstephan.
L'utilisation des résultats de SIMAP est entièrement libre pour l'éducation et la recherche publique.
En outre Simap soutien de nombreux autres travaux en science de la vie. Choisir SIMAP c'est accélérer non seulement nos recherches mais aussi les recherches de nombreux autres projets à travers le monde.

Pour participer à ce projet avec la team Fansub for Research, rendez vous à cette adresse :
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/team_display.php?teamid=1541

Topic de l'AllianceFrancophone : http://www.boinc-af.org/content/view/111/219/


Dernière édition par feb le Jeu 23 Déc 2010 - 15:40, édité 1 fois

_________________
pervers02 Modo en N&B à votre service pervers02

feb
Admin en Noir et Blanc
Admin en Noir et Blanc

Nombre de messages : 5244
Age : 35
Date d'inscription : 02/06/2006

Voir le profil de l'utilisateur

Revenir en haut Aller en bas

Re: [SV] BoincSIMAP (Linux - Win - Mac)

Message par feb le Lun 24 Sep 2007 - 12:16

Informations complémentaires

Délai de retour des unités Simap : 10 jours.

Config minimale recommandée (RAM) : SIMAP@home 5.10 (24,2 Mo).

Origine géographique du projet : Université technique de Munich MIPS - Allemagne.

Fin du projet : Non fixée - Projet intermittent.
Reprise des calculs le dernier ou le premier jour de chaque mois avec une durée de quelques jours.

_________________
pervers02 Modo en N&B à votre service pervers02

feb
Admin en Noir et Blanc
Admin en Noir et Blanc

Nombre de messages : 5244
Age : 35
Date d'inscription : 02/06/2006

Voir le profil de l'utilisateur

Revenir en haut Aller en bas

Re: [SV] BoincSIMAP (Linux - Win - Mac)

Message par feb le Jeu 11 Oct 2007 - 0:09

Création d'un nouveau portail pour la base de données SIMAP

Le nouveau portail fournit des outils plus efficaces, l'intégration d'annotations fonctionnelles à l'aide de PEDANT (Protein Extraction, Description, and ANalysis Tool - annotation exhaustive et automatique d'une séquence protéique ou d'un protéome complet), le regroupement de séquences, et le nouveau "DomainBLAST" permettant de rechercher les homologues en partant de la structure.
http://webclu.bio.wzw.tum.de/simap/c/portal/layout?p_l_id=PUB.1001.1

Source

_________________
pervers02 Modo en N&B à votre service pervers02

feb
Admin en Noir et Blanc
Admin en Noir et Blanc

Nombre de messages : 5244
Age : 35
Date d'inscription : 02/06/2006

Voir le profil de l'utilisateur

Revenir en haut Aller en bas

Re: [SV] BoincSIMAP (Linux - Win - Mac)

Message par Contenu sponsorisé Aujourd'hui à 12:49


Contenu sponsorisé


Revenir en haut Aller en bas

Voir le sujet précédent Voir le sujet suivant Revenir en haut

- Sujets similaires

 
Permission de ce forum:
Vous ne pouvez pas répondre aux sujets dans ce forum